В институте сельского хозяйства и агротехнологий Каракалпакстана в докторантуре готовятся кадры по следующим направлениям.
- 01.05 – Селекция и семеноводство;
- 01.09 – Защита растений;
- 01.06 – Овощеводство;
- 01.02 – Мелиорация и орошаемое земледелие;
- 01.04 – Агрохимия;
- 01.11 – Хранение и переработка сельскохозяйственной продукции;
- 01.08 – Растениеводство;
- 01.01 – Общее земледелие. Хлопководство;
- 01.07 – Плодоводство и виноградарство;
- 01.10 – Землеустройство, кадастр и мониторинг земель;
- 02.03 – Частная зоотехния. Технология производства продукции животноводства;
- 02.04 – Шелководство;
- 03.03 – Интродукция лекарственных растений, технология их выращивания и агрофармакоэкология;
- 03.01 – Лесные культуры. Селекция и семеноводство, озеленение городов. Агролесомелиорация и создание защитных лесных насаждений;
- 07.01 – Машины для сельскохозяйственной мелиорации. Механизация сельскохозяйственных и мелиоративных работ;
- 00.04 – Экономика сельского хозяйства;
- 00.10 – Экология;
- 00.13 – Почвоведение;
- 00.16 – Гидробиология.
