Qoraqalpogʻiston qishloq xoʻjaligi va agrotexnologiyalar institutida doktorantura institutida quyidagi yoʻnalishlarda kadrlar tayyorlanadi.

Seleksiya va urugʻchilik;

 Oʻsimliklarni himoya qilish;

 Sabzavotchilik;

 Melioratsiya va sugʻorma dehqonchilik;

 Agrokimyo;

 Qishloq xoʻjaligi maxsulotlarini saqlash va qayta ishlash;

 Oʻsimlikshunoslik;

 Umumiy dehqonchilik. Paxtachilik;

 Mevachilik va uzumchilik;

 Yer tuzish, kadastr va yer monitoringi;

 Xususiy zootexnika. Chorvachilik maxsulotlarini ishlab chiqarish texnologiyasi;

 Ipakchilik;

 Dorivor oʻsimliklar introduktsiyasi, yetishtirish texnologiyasi va agrofarmoekologiyasi;

 Oʻrmon ekinlari. Seleksiya, urugʻchilik va shaharlarni koʻkalamzorlashtirish. Oʻrmonlar agromelioratsiyasi va himoya oʻrmonlarini barpo etish;

 Qishloq xoʻjaligi melioratsiya mashinalari. Qishloq xoʻjaligi va melioratsiya ishlarini mexanizatsiyalash;

 Qishloq xoʻjaligi iqtisodiyoti;

 Ekologiya;

 Tuporshunoslik;

 Gidrobiologiya